119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0433 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  100 
 
 		 930 aa  1898    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  29.8 
 
 		 360 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.24 
 
 		 1293 aa  85.9  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.66 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.73 
 
 		 930 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.14 
 
 		 368 aa  79.7  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.61 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.17 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  31.41 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.76 
 
 		 579 aa  75.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  26.45 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  27.6 
 
 		 668 aa  74.7  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  30.14 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  27.72 
 
 		 354 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.7 
 
 		 752 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.32 
 
 		 676 aa  74.3  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  30.66 
 
 		 322 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  30.38 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.99 
 
 		 831 aa  72.8  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1030 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.34 
 
 		 379 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  31.28 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  27.89 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  24.74 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  27.69 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  28.52 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  26.69 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  27.5 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.8 
 
 		 326 aa  67  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  31.7 
 
 		 1163 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  25.78 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1146 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  27.2 
 
 		 361 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  25.5 
 
 		 318 aa  63.9  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  28.07 
 
 		 627 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  22.39 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.36 
 
 		 709 aa  63.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  25.7 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  25.43 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.73 
 
 		 1140 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  27.59 
 
 		 899 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.1 
 
 		 321 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.89 
 
 		 588 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.62 
 
 		 522 aa  60.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  27.85 
 
 		 418 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  25.45 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  28.25 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.99 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  22.84 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 		 396 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  23.79 
 
 		 646 aa  57  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.14 
 
 		 1292 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.79 
 
 		 898 aa  55.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  26.52 
 
 		 525 aa  55.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.61 
 
 		 307 aa  55.1  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1177 aa  54.7  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  23.76 
 
 		 480 aa  54.3  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1030 aa  54.3  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  24.92 
 
 		 309 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  25.4 
 
 		 439 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.1 
 
 		 930 aa  53.5  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  24.41 
 
 		 315 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  25.28 
 
 		 436 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  26.18 
 
 		 390 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2977  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 665 aa  52.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0272113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 		 850 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.83 
 
 		 693 aa  52.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  31.78 
 
 		 903 aa  52  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  23.74 
 
 		 658 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  23.75 
 
 		 442 aa  51.2  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  24.11 
 
 		 658 aa  51.2  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  25.81 
 
 		 487 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  32.11 
 
 		 1026 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.69 
 
 		 387 aa  50.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  24.46 
 
 		 655 aa  50.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1051 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  24.27 
 
 		 584 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2952  hypothetical protein  33.01 
 
 		 185 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  27.92 
 
 		 284 aa  50.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  28.41 
 
 		 963 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  25.08 
 
 		 314 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  28.14 
 
 		 581 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  23.24 
 
 		 571 aa  48.9  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  23.18 
 
 		 392 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  29.91 
 
 		 521 aa  48.5  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  24.1 
 
 		 805 aa  48.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  23.77 
 
 		 656 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  24.68 
 
 		 331 aa  48.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  24.24 
 
 		 315 aa  48.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  28.11 
 
 		 315 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  35.65 
 
 		 364 aa  47.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  28.36 
 
 		 334 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  24.68 
 
 		 597 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  27.19 
 
 		 318 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  23.19 
 
 		 747 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1750 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  29.21 
 
 		 326 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  23.13 
 
 		 449 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.45 
 
 		 650 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>