46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3158 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  100 
 
 		 597 aa  1240    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  49.17 
 
 		 584 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  40.03 
 
 		 553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 576 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  35 
 
 		 571 aa  279  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  29.17 
 
 		 645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  25.32 
 
 		 867 aa  124  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  36.11 
 
 		 229 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  37.2 
 
 		 226 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  36.54 
 
 		 261 aa  100  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  31.15 
 
 		 245 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  32.24 
 
 		 232 aa  94.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  30.35 
 
 		 254 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  28.97 
 
 		 237 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  30.94 
 
 		 280 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  30.89 
 
 		 240 aa  90.9  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1867  cytochrome c family protein  27.64 
 
 		 367 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.189197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  30.98 
 
 		 249 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1922  hypothetical protein  26.84 
 
 		 365 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.058043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  26.18 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  27.99 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1786  cytochrome c family protein  28.83 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  30.09 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  29.06 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  27.45 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  27.82 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  26.58 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  26.47 
 
 		 1916 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  24.3 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  23.95 
 
 		 1196 aa  60.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1284 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  27.98 
 
 		 1848 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  23.1 
 
 		 658 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  23.14 
 
 		 449 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  23.12 
 
 		 658 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 771 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  22.28 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  24.68 
 
 		 930 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  26.8 
 
 		 370 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  22.22 
 
 		 650 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  24.68 
 
 		 1009 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1197  hypothetical protein  27.43 
 
 		 392 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  26 
 
 		 434 aa  44.3  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  24.61 
 
 		 658 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  23.28 
 
 		 427 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0533  cytochrome c family protein, putative  28.57 
 
 		 134 aa  43.9  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00012786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>