49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3226 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  100 
 
 		 576 aa  1178    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  46.8 
 
 		 553 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  36.95 
 
 		 571 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  37.36 
 
 		 597 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  39.21 
 
 		 584 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  29.36 
 
 		 645 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  35.42 
 
 		 249 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1867  cytochrome c family protein  29.32 
 
 		 367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.189197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  33.73 
 
 		 254 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1922  hypothetical protein  29.61 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.058043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 229 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1786  cytochrome c family protein  27.92 
 
 		 363 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  36.46 
 
 		 261 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  30.84 
 
 		 867 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  31.77 
 
 		 280 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  29.35 
 
 		 279 aa  96.7  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  28.72 
 
 		 279 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  30.8 
 
 		 245 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  31.52 
 
 		 226 aa  93.2  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  29.69 
 
 		 270 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  28.41 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  26.19 
 
 		 237 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  29.25 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  28.68 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  26.91 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  29.31 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  28.82 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  25.72 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  23.88 
 
 		 440 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  26.01 
 
 		 1848 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  24.74 
 
 		 449 aa  57  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  25.08 
 
 		 374 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  23.41 
 
 		 442 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  23.08 
 
 		 362 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  25.84 
 
 		 1916 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  28.32 
 
 		 331 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  24.61 
 
 		 1196 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.24 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1284 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3748  hypothetical protein  26.8 
 
 		 198 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1883  hypothetical protein  26.8 
 
 		 198 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00949083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  23.44 
 
 		 646 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  24.89 
 
 		 650 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  24.9 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  24.9 
 
 		 309 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  25.79 
 
 		 656 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  24.51 
 
 		 315 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2952  hypothetical protein  29.27 
 
 		 185 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  27.45 
 
 		 358 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>