24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2749 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  45.05 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  38.31 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  35.47 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  34.93 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  31.05 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  28.1 
 
 		 553 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  32.27 
 
 		 584 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  31.69 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  31.42 
 
 		 576 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  31.45 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  25.99 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  29.41 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  29.96 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  27.62 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  30.09 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  26.06 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  26.77 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  28.52 
 
 		 867 aa  65.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  25.93 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  26.41 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  27.92 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  25.1 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  25.83 
 
 		 645 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>