24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3113 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  38.73 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  35.47 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  35.93 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  30.14 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  30.95 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  29.14 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  26.79 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  27 
 
 		 571 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  25.39 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  29.45 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  25.68 
 
 		 553 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  28.82 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  27.72 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  26.57 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  25.56 
 
 		 867 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  25 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  24.27 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  26.22 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  25.23 
 
 		 645 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  28.77 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  24.03 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  21.84 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0533  cytochrome c family protein, putative  26.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00012786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>