43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0741 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  100 
 
 
645 aa  1326    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  30.77 
 
 
571 aa  227  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  28.92 
 
 
553 aa  185  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  29.27 
 
 
576 aa  180  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  30.22 
 
 
597 aa  176  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  26.86 
 
 
584 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  25 
 
 
867 aa  97.1  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1867  cytochrome c family protein  28.69 
 
 
367 aa  95.9  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.189197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1922  hypothetical protein  26.23 
 
 
365 aa  94.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.058043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1786  cytochrome c family protein  26.65 
 
 
363 aa  89  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  32.91 
 
 
226 aa  84  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  36.54 
 
 
229 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  29.51 
 
 
240 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  29.48 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  35.6 
 
 
261 aa  72  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  29.19 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  30.63 
 
 
279 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  27.88 
 
 
280 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  28 
 
 
249 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  29.87 
 
 
232 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  27.07 
 
 
1196 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  26.91 
 
 
276 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  24.84 
 
 
1284 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  27.01 
 
 
270 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  26.67 
 
 
279 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  29.84 
 
 
237 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  26.29 
 
 
254 aa  56.6  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  27.89 
 
 
1916 aa  53.9  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  25.37 
 
 
263 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  24.79 
 
 
646 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  22.97 
 
 
426 aa  50.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  22.2 
 
 
449 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  25.1 
 
 
294 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  24.71 
 
 
429 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  22.88 
 
 
480 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  23.27 
 
 
656 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  24.09 
 
 
436 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  23.83 
 
 
436 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  23.06 
 
 
436 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  22.04 
 
 
650 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  25.79 
 
 
1848 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  23.75 
 
 
658 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  25.44 
 
 
427 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>