24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1921 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  521  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  54.55 
 
 		 254 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  49.29 
 
 		 279 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  35.21 
 
 		 571 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  35.48 
 
 		 576 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  30.12 
 
 		 553 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  31.06 
 
 		 280 aa  88.6  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  32.72 
 
 		 584 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  31.03 
 
 		 279 aa  85.5  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  32.17 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  27.88 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  31.58 
 
 		 867 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  29.15 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  32.29 
 
 		 597 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  30.86 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  28.3 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  30.71 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  28.99 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  29.07 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  27.94 
 
 		 645 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  26.58 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  26.41 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  26.78 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  23.38 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>