24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0557 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  100 
 
 		 280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  59.15 
 
 		 279 aa  314  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  32.07 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  29.88 
 
 		 571 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 553 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  30.41 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  32.53 
 
 		 576 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  32.24 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  30.3 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  27.93 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  27.9 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  30.86 
 
 		 597 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  31.06 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  30.32 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  28.91 
 
 		 584 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  29.45 
 
 		 867 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  27.94 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  31.39 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  28.47 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  27.39 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  25.17 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  24.82 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  26.99 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>