25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2896 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  100 
 
 
240 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  44.4 
 
 
232 aa  174  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  35.27 
 
 
237 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  36.77 
 
 
229 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  30.41 
 
 
280 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  32.31 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  33.2 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  30.86 
 
 
584 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  31.52 
 
 
264 aa  92  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  33.8 
 
 
571 aa  89  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  30.77 
 
 
597 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  27.53 
 
 
279 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  30.61 
 
 
553 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  29.12 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  30.45 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  31.64 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  31.52 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  30.86 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  29.73 
 
 
576 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  27.47 
 
 
867 aa  75.1  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  28.9 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  30.22 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  30.53 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  29.51 
 
 
645 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1989  hypothetical protein  27.71 
 
 
418 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>