24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4134 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  100 
 
 		 294 aa  587  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  30.5 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  35.42 
 
 		 867 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  30.96 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  32.5 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  30.39 
 
 		 226 aa  92.8  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  29.34 
 
 		 576 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  31.09 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  32.75 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  27.72 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  31.16 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  27.82 
 
 		 597 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  29.14 
 
 		 571 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  28.68 
 
 		 553 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  26.92 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  25.68 
 
 		 584 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  29.52 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  27.92 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  28.07 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  24.28 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  22.05 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  25.1 
 
 		 645 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>