24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1868 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  100 
 
 		 254 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  57.09 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  54.55 
 
 		 249 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  34.78 
 
 		 553 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  33.48 
 
 		 571 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  34.51 
 
 		 576 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  33.49 
 
 		 584 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  32.11 
 
 		 597 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  28.76 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  29.12 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  28.94 
 
 		 867 aa  82.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  32 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  28.38 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  32.46 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  25.09 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  28.51 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  24.39 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  26.54 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  28.38 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  29.17 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  23.31 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  26.29 
 
 		 645 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  23.87 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>