25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0618 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  44.4 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  43.72 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  39.09 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  37.9 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  37.5 
 
 		 571 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  35.42 
 
 		 553 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  36.25 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  32.07 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  30.45 
 
 		 584 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  30.77 
 
 		 867 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  30.57 
 
 		 294 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  28.47 
 
 		 279 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  32.29 
 
 		 597 aa  89  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  32.17 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  30.86 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  29.07 
 
 		 576 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  28.91 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  32 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  26.95 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  32.22 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  28.74 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  28.94 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  29.87 
 
 		 645 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  45 
 
 		 1611 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>