34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4123 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  100 
 
 		 867 aa  1777    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  28.78 
 
 		 571 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  26.85 
 
 		 553 aa  145  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  25.71 
 
 		 597 aa  129  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  24.62 
 
 		 584 aa  125  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0255  cytochrome c family protein  32.44 
 
 		 229 aa  104  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  30.84 
 
 		 576 aa  102  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0618  cytochrome c family protein  30.21 
 
 		 232 aa  101  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000761444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  24.1 
 
 		 645 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4134  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 294 aa  95.5  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0244  cytochrome c family protein  31.4 
 
 		 261 aa  94.7  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2913  cytochrome c family protein  27.73 
 
 		 279 aa  92  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0252  cytochrome c family protein  31.03 
 
 		 226 aa  89.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0557  cytochrome c family protein  28.66 
 
 		 280 aa  89  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1921  hypothetical protein  29.57 
 
 		 249 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1868  cytochrome c family protein  28.94 
 
 		 254 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0930028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1284 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3837  hypothetical protein  26.96 
 
 		 237 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2896  cytochrome c family protein  28.38 
 
 		 240 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1787  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3157  cytochrome c family protein  29.93 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3221  cytochrome c family protein  29.29 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  23.15 
 
 		 1196 aa  67.4  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2749  hypothetical protein  28.24 
 
 		 270 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3113  hypothetical protein  25.48 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  26.22 
 
 		 1916 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0924  hypothetical protein  26.6 
 
 		 263 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1197  hypothetical protein  29.66 
 
 		 392 aa  56.6  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0601  hypothetical protein  25.9 
 
 		 349 aa  51.6  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000425855  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  31.48 
 
 		 337 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  40 
 
 		 331 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1922  hypothetical protein  22.03 
 
 		 365 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.058043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  24.71 
 
 		 1848 aa  45.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1867  cytochrome c family protein  25.31 
 
 		 367 aa  44.3  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.189197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>