16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1197 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1197  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  818    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0601  hypothetical protein  38.92 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000425855  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  31.47 
 
 		 1916 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  30.22 
 
 		 1848 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2808  cytochrome c family protein  33.12 
 
 		 189 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000226609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1284 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  32.14 
 
 		 712 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2294  cytochrome c family protein  44.78 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  25.78 
 
 		 1196 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  28.24 
 
 		 867 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  33.78 
 
 		 884 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  26.22 
 
 		 571 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  23.48 
 
 		 553 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  28.17 
 
 		 806 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  27.43 
 
 		 597 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0930  cytochrome c family protein  41.56 
 
 		 489 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>