18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1867 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1867  cytochrome c family protein  100 
 
 		 367 aa  761    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.189197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1786  cytochrome c family protein  69.21 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1922  hypothetical protein  65.56 
 
 		 365 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.058043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  34.26 
 
 		 571 aa  162  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  30.93 
 
 		 553 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  29.32 
 
 		 576 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  28.95 
 
 		 645 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  27.55 
 
 		 584 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  27.64 
 
 		 597 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  26.79 
 
 		 1196 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  27.37 
 
 		 1848 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  29.41 
 
 		 1916 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  26.24 
 
 		 362 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  21.89 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  27.31 
 
 		 1496 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  30.37 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  22.26 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  23.6 
 
 		 440 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>