18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1786 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1786  cytochrome c family protein  100 
 
 		 363 aa  748    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1867  cytochrome c family protein  69.21 
 
 		 367 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.189197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1922  hypothetical protein  63.29 
 
 		 365 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.058043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  35.28 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  30.55 
 
 		 553 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  27.92 
 
 		 576 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  26.03 
 
 		 584 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  26.91 
 
 		 645 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  28.94 
 
 		 597 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  25.67 
 
 		 1196 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  28.05 
 
 		 1848 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  24.42 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1284 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  25.95 
 
 		 1916 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  23.05 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  22.34 
 
 		 642 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  23.24 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  22.27 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>