38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5035 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  100 
 
 
455 aa  858    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  29.43 
 
 
377 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  35.57 
 
 
299 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  34.17 
 
 
302 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  32.77 
 
 
294 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  32.48 
 
 
280 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  32.48 
 
 
280 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  32.48 
 
 
280 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  30.28 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  28.23 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  28.22 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  29.17 
 
 
290 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  30 
 
 
1009 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 
892 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.93 
 
 
1949 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.73 
 
 
841 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  37.24 
 
 
1147 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  24.54 
 
 
1293 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  22.9 
 
 
1351 aa  50.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.76 
 
 
1750 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  25.52 
 
 
1557 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  27.03 
 
 
684 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  25.51 
 
 
664 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1878  hypothetical protein  39.66 
 
 
635 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154844  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  29.81 
 
 
331 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  35.71 
 
 
1577 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  27.36 
 
 
349 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  27.72 
 
 
328 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 
719 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.77 
 
 
1834 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  27.34 
 
 
950 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  24.76 
 
 
863 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  29.51 
 
 
743 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  30.39 
 
 
316 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  27.2 
 
 
335 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 
770 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.84 
 
 
831 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.07 
 
 
1667 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>