61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3844 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  100 
 
 
280 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  99.64 
 
 
280 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  99.64 
 
 
280 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  52.71 
 
 
299 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  51.59 
 
 
291 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  50.54 
 
 
302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  48.01 
 
 
294 aa  231  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  46.89 
 
 
290 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  39.65 
 
 
296 aa  215  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  47.27 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  36.5 
 
 
377 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  52.98 
 
 
272 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  30.4 
 
 
392 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  33.86 
 
 
349 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  32.35 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.91 
 
 
351 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  32.48 
 
 
455 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  28.99 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  27.73 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  27.62 
 
 
927 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  27.13 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  29.06 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  29.96 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  26.94 
 
 
416 aa  68.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  27.09 
 
 
368 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  30.32 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  28.44 
 
 
316 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.04 
 
 
1130 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  29.93 
 
 
1577 aa  52.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.61 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  25.55 
 
 
657 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  25.55 
 
 
657 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  25.55 
 
 
657 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  25.55 
 
 
657 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  25.55 
 
 
657 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  25.55 
 
 
657 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  25.18 
 
 
657 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  21.84 
 
 
524 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  28.33 
 
 
1189 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  25.37 
 
 
841 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  30.43 
 
 
314 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.5 
 
 
971 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1718  hypothetical protein  23.44 
 
 
425 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
1018 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0216  putative surface layer protein  23.44 
 
 
425 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  27.86 
 
 
1051 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.7 
 
 
517 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3511  hypothetical protein  25.4 
 
 
408 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.621558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  25.56 
 
 
1009 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  21.97 
 
 
1608 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  27.68 
 
 
543 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  23.66 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  20.59 
 
 
1557 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2754  hypothetical protein  26.97 
 
 
314 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.03 
 
 
3563 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.1 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  24.09 
 
 
667 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.87 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.1 
 
 
545 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.11 
 
 
305 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>