57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0574 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  93.36 
 
 		 316 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  38.82 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.54 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  36.91 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  33.55 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  31.28 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  27.24 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  30 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  28.06 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  26.28 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  30.86 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  28.57 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  30.8 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.46 
 
 		 927 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  22.56 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  27.97 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  28.63 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  27.2 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  28.44 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  27.98 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  27.98 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  25.61 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  26.81 
 
 		 542 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  21.92 
 
 		 524 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  27.78 
 
 		 1004 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  26.74 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  24.92 
 
 		 667 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  29.24 
 
 		 377 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1929  two component regulator propeller domain protein  27.49 
 
 		 775 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00113538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  25.98 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  26.89 
 
 		 921 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.43 
 
 		 1351 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  24.66 
 
 		 1324 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  25.8 
 
 		 543 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5444  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.19 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  25.45 
 
 		 533 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.5 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  28.99 
 
 		 657 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 732 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1009 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  28.99 
 
 		 657 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  28.99 
 
 		 657 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  28.99 
 
 		 657 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1608 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  31.68 
 
 		 455 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  28.99 
 
 		 657 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  28.99 
 
 		 657 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  28.99 
 
 		 657 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  25.6 
 
 		 542 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  25.62 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  29.91 
 
 		 1008 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  27.68 
 
 		 1397 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  26.7 
 
 		 1024 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 1211 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.93 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.93 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>