70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1898 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  100 
 
 		 299 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  65.64 
 
 		 302 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  58.13 
 
 		 291 aa  331  9e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  46.71 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  52.71 
 
 		 280 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  52.35 
 
 		 280 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  52.35 
 
 		 280 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  50 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  51.07 
 
 		 290 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  49.31 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  40.07 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  63.12 
 
 		 272 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  35.57 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  33.8 
 
 		 392 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  31.09 
 
 		 331 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  30 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  30.08 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  28.76 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.38 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  26.54 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25.82 
 
 		 927 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  27.55 
 
 		 368 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  26.42 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  27.2 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1009 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  32.39 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  22.08 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3511  hypothetical protein  28.42 
 
 		 408 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.621558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 		 732 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 		 770 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  20.27 
 
 		 524 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.95 
 
 		 550 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.95 
 
 		 538 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  29.95 
 
 		 538 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  24.75 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.1 
 
 		 406 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  23.51 
 
 		 841 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  21.5 
 
 		 1750 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  23.58 
 
 		 667 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  27.62 
 
 		 805 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  21.6 
 
 		 863 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  27.4 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  27.4 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  26.37 
 
 		 502 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  27.4 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  27.4 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  27.4 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  25 
 
 		 533 aa  46.2  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 719 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  21.07 
 
 		 892 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  26.71 
 
 		 657 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.34 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  29.77 
 
 		 542 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 776 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  28.46 
 
 		 543 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  24.23 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  26.71 
 
 		 657 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.53 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.56 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  29.41 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.1 
 
 		 545 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4918  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.62 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117058  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.55 
 
 		 574 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  22.69 
 
 		 1293 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.57 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.45 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  30 
 
 		 639 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  30.33 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>