120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1558 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  100 
 
 		 294 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  57.14 
 
 		 302 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  55.76 
 
 		 291 aa  287  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  50 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  52.14 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  43.17 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  48.01 
 
 		 280 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  47.29 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  47.29 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  46.18 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  37.69 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  47.17 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  33.09 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  31.95 
 
 		 349 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  28.97 
 
 		 392 aa  99.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  26.79 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  29.49 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.32 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  26.75 
 
 		 416 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 455 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  29.58 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  30.9 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  25.85 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  29.05 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  28.04 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  26.94 
 
 		 927 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  27.97 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  23.26 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  23.61 
 
 		 657 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  23.26 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  23.26 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  23.26 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  23.26 
 
 		 657 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  27.07 
 
 		 502 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  23.26 
 
 		 657 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  23.45 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1949 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.01 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1009 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.34 
 
 		 1130 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.17 
 
 		 531 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 		 863 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 		 770 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  27.76 
 
 		 538 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.76 
 
 		 538 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.98 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.76 
 
 		 550 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  22.87 
 
 		 1293 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  24.43 
 
 		 841 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.08 
 
 		 693 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  27.8 
 
 		 542 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  20.36 
 
 		 524 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1170 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 		 892 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.21 
 
 		 529 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 772 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1750 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.57 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.73 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  24.16 
 
 		 732 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 		 807 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.63 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3511  hypothetical protein  27.95 
 
 		 408 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.621558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0016  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.7 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.726882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0015  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.78 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.98 
 
 		 318 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  23.57 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  24.91 
 
 		 391 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.07 
 
 		 406 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  24.3 
 
 		 639 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  20.49 
 
 		 1557 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  25.62 
 
 		 971 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  27.87 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  24.49 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.1 
 
 		 689 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  20.31 
 
 		 533 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 776 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.88 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.91 
 
 		 451 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  26.36 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.57 
 
 		 553 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.87 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  24.66 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  26.61 
 
 		 543 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.94 
 
 		 279 aa  45.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  23.13 
 
 		 580 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  31.65 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  25 
 
 		 1017 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.43 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1026 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  21.14 
 
 		 522 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  24.11 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  30.77 
 
 		 487 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1921  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.84 
 
 		 962 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2274  hypothetical protein  26.84 
 
 		 962 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>