58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2867 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  100 
 
 		 291 aa  570  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  63.01 
 
 		 302 aa  361  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  58.13 
 
 		 299 aa  331  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  55.76 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  45.55 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  51.59 
 
 		 280 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  51.59 
 
 		 280 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  51.59 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  52.52 
 
 		 285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  44.71 
 
 		 290 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  42.09 
 
 		 377 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  59.75 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  32.93 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.27 
 
 		 351 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  30.63 
 
 		 455 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  28.93 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  29.18 
 
 		 332 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  25.4 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  29.2 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  28.81 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  26.15 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  29.61 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25 
 
 		 927 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  28.57 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  22.92 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  28.51 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1009 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  31.44 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  20.49 
 
 		 524 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3511  hypothetical protein  26.61 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.621558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  21 
 
 		 533 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  23.17 
 
 		 892 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  26.74 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  23.92 
 
 		 667 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  25.11 
 
 		 543 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  23.93 
 
 		 657 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  23.93 
 
 		 657 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  23.93 
 
 		 657 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  23.93 
 
 		 657 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  23.93 
 
 		 657 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  23.61 
 
 		 657 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  23.61 
 
 		 657 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 		 770 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 		 772 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  28.37 
 
 		 542 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  33.87 
 
 		 542 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  22.68 
 
 		 580 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.7 
 
 		 550 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.7 
 
 		 538 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  28.7 
 
 		 538 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.16 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  25 
 
 		 1608 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  27.67 
 
 		 1175 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3588  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  22.57 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  26.32 
 
 		 502 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.91 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0435  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.23 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.369431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.23 
 
 		 531 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>