64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1591 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  100 
 
 
686 aa  1377    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  37.67 
 
 
716 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  27.9 
 
 
680 aa  242  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0291  NHL repeat-containing protein  28.79 
 
 
669 aa  239  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1595  hypothetical protein  27.79 
 
 
540 aa  198  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.19 
 
 
930 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  29.25 
 
 
676 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.88 
 
 
930 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  31.94 
 
 
1030 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  25.79 
 
 
627 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  24.8 
 
 
1177 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.31 
 
 
588 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.73 
 
 
522 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  34.31 
 
 
359 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  22.49 
 
 
379 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  25.61 
 
 
1293 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.07 
 
 
831 aa  61.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  23.62 
 
 
668 aa  60.1  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  25.67 
 
 
396 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  24.73 
 
 
412 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  29.93 
 
 
343 aa  58.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.97 
 
 
391 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  30.25 
 
 
664 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  37.63 
 
 
1146 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.67 
 
 
752 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  22.31 
 
 
363 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  27.36 
 
 
346 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  33.91 
 
 
365 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  25.14 
 
 
1163 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  37.21 
 
 
1140 aa  54.7  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  24.48 
 
 
354 aa  54.3  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25.4 
 
 
491 aa  53.9  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
772 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  22.49 
 
 
360 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.33 
 
 
709 aa  51.6  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.51 
 
 
307 aa  51.2  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  36.99 
 
 
579 aa  50.8  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  28.97 
 
 
372 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 
850 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 
368 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.14 
 
 
1292 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0414  NHL repeat containing protein  32.98 
 
 
803 aa  48.5  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316951  normal  0.387155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.04 
 
 
693 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 
1351 aa  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
732 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  23.69 
 
 
353 aa  47.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  31.2 
 
 
384 aa  47.4  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  25.13 
 
 
447 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  26.17 
 
 
841 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.17 
 
 
343 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  30.99 
 
 
652 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  27.83 
 
 
343 aa  45.8  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  31.51 
 
 
805 aa  45.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  29.67 
 
 
319 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  30.77 
 
 
903 aa  45.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
770 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.6 
 
 
343 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  36.47 
 
 
425 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0812  hypothetical protein  25 
 
 
495 aa  44.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  22.54 
 
 
436 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  25.55 
 
 
395 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  28.33 
 
 
700 aa  44.3  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  28.26 
 
 
367 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 
807 aa  43.9  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>