24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3441 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  790    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  87.53 
 
 
413 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  84.86 
 
 
413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  60.96 
 
 
413 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3646  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
424 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0020  hypothetical protein  32.2 
 
 
440 aa  92.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  29.49 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  35.11 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42030  hypothetical protein  30.19 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3704  hypothetical protein  32.32 
 
 
329 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5509  hypothetical protein  32.32 
 
 
329 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.34 
 
 
326 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  28.07 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  33.88 
 
 
510 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0422  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  43.27 
 
 
296 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.13548  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.81 
 
 
316 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3389  hypothetical protein  29.52 
 
 
315 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  34.94 
 
 
297 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  30.81 
 
 
297 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  30.81 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  32.97 
 
 
288 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  34.21 
 
 
297 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>