23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1405 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  650    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5509  hypothetical protein  55.22 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3704  hypothetical protein  55.22 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.67 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.67 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  28.06 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42030  hypothetical protein  29.33 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4119  hypothetical protein  52.63 
 
 		 118 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3796  hypothetical protein  51.58 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  29.15 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  23.29 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.83 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3820  superoxide dismutase (sodC), Cu-Zn family  26.83 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.673254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.95 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  28.01 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0020  hypothetical protein  26.75 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  28.16 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.66 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3646  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.88 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3570  superoxide dismutase  25.68 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3418  hypothetical protein  24.21 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.32 
 
 		 545 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>