28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3592 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  87.29 
 
 		 422 aa  634    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  779    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  96.35 
 
 		 413 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  61.64 
 
 		 413 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3646  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0020  hypothetical protein  29.75 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42030  hypothetical protein  30.94 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  35.88 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.53 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  28.67 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5509  hypothetical protein  30.95 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3704  hypothetical protein  30.95 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  27.97 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4965  hypothetical protein  30.56 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.66 
 
 		 347 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.66 
 
 		 347 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3389  hypothetical protein  30.81 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0422  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.13 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.13548  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2623  hypothetical protein  35.96 
 
 		 648 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.722578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  29.07 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  30.48 
 
 		 288 aa  47  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.33 
 
 		 553 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  42.17 
 
 		 510 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5368  hypothetical protein  29.33 
 
 		 666 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100137  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  40.82 
 
 		 288 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  32.03 
 
 		 510 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  31.52 
 
 		 297 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>