21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42030  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  48.15 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  48.15 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  43.96 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  30.11 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5509  hypothetical protein  29.68 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3704  hypothetical protein  29.68 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  30.94 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  30.94 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  30.19 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.5 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.12 
 
 		 553 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.65 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  25.45 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.7 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.18 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3646  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 424 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  24.34 
 
 		 1293 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.77 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  21.19 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.07 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>