31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3813 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  34.18 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.38 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.35 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.35 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.56 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  27.83 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  26.6 
 
 		 510 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3820  superoxide dismutase (sodC), Cu-Zn family  27.42 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.673254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3570  superoxide dismutase  26.82 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3704  hypothetical protein  28.19 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5509  hypothetical protein  28.19 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4965  hypothetical protein  27.38 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  25.22 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  25.34 
 
 		 422 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3300  superoxide dismutase  25.61 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  23.94 
 
 		 413 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  24.91 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3646  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.87 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  28.17 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.42 
 
 		 1292 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  23.61 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  23.53 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  25.54 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0020  hypothetical protein  23.18 
 
 		 440 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.39 
 
 		 930 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.25 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  22.75 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  27.7 
 
 		 400 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.19 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>