21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4965 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4965  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3389  hypothetical protein  62.02 
 
 		 315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3418  hypothetical protein  49.67 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0365  hypothetical protein  39 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2064  superoxide dismutase  35.11 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3570  superoxide dismutase  35.93 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  31.8 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3300  superoxide dismutase  30.88 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522021  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.14 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3820  superoxide dismutase (sodC), Cu-Zn family  25 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.673254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  27.11 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  23.77 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3646  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 424 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.25 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.73 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.73 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.57 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0020  hypothetical protein  29.51 
 
 		 440 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  29.8 
 
 		 413 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  31.03 
 
 		 634 aa  42.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  28.5 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>