16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3820 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3820  superoxide dismutase (sodC), Cu-Zn family  100 
 
 		 320 aa  643    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.673254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  31.96 
 
 		 510 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3300  superoxide dismutase  31.73 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3570  superoxide dismutase  28.81 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2064  superoxide dismutase  37.56 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3389  hypothetical protein  28.33 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0365  hypothetical protein  30.82 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  26.83 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.42 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.33 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  28.44 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3418  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4965  hypothetical protein  24.83 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.64 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.98 
 
 		 413 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  26.03 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>