38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2661 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.03 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.18 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.68 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.68 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  22.87 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  22.95 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3820  superoxide dismutase (sodC), Cu-Zn family  28.44 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.673254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  22.45 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  27.08 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.11 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3570  superoxide dismutase  25.84 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  27.6 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  28.07 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4965  hypothetical protein  27.11 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  28.76 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.87 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.49 
 
 		 445 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.95 
 
 		 1292 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3300  superoxide dismutase  23.2 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  30.23 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.78 
 
 		 1916 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.57 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.02 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.63 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.5 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.95 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  24.76 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.34 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.48 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.48 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.48 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.49 
 
 		 2296 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3389  hypothetical protein  27.39 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.12 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  22.97 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.89 
 
 		 268 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  29.84 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>