23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1081 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  60.81 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  60.81 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42030  hypothetical protein  43.62 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3704  hypothetical protein  28.9 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5509  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  28.06 
 
 		 325 aa  95.9  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  35.11 
 
 		 422 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.07 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.52 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.22 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  35.88 
 
 		 413 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  22.45 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  35.11 
 
 		 413 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0020  hypothetical protein  24.8 
 
 		 440 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4965  hypothetical protein  23.11 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0365  hypothetical protein  26.71 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3646  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 424 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3570  superoxide dismutase  31.16 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  24.58 
 
 		 623 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2064  superoxide dismutase  25.18 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3820  superoxide dismutase (sodC), Cu-Zn family  26.03 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.673254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  22.35 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>