26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3974 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
347 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
347 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1081  hypothetical protein  60.81 
 
 
322 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42030  hypothetical protein  48.15 
 
 
332 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3704  hypothetical protein  30.18 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5509  hypothetical protein  30.84 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1405  hypothetical protein  28.67 
 
 
325 aa  99.4  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.386776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3813  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.35 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  21.68 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5084  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.1 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.65 
 
 
413 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  29.97 
 
 
510 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3646  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
424 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3570  superoxide dismutase  28.79 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  28.57 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3524  hypothetical protein  27.16 
 
 
413 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.661679  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  27.5 
 
 
308 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4965  hypothetical protein  27 
 
 
325 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.89 
 
 
1292 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  51.22 
 
 
963 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3592  hypothetical protein  28.08 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.92 
 
 
3563 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.29 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.11 
 
 
545 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  23.84 
 
 
292 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.82 
 
 
330 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>