70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4205 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
545 aa  1086    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  35.67 
 
 
365 aa  180  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  36.99 
 
 
374 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  36.31 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  36.94 
 
 
366 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  32.6 
 
 
377 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  29.25 
 
 
358 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  29.46 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  34.35 
 
 
376 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  35.19 
 
 
383 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  30.23 
 
 
377 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  30.21 
 
 
352 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  32.08 
 
 
396 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  31.53 
 
 
403 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  30.75 
 
 
390 aa  143  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  31.4 
 
 
389 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  32.57 
 
 
421 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  31.58 
 
 
379 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  30.46 
 
 
362 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.36 
 
 
175 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.52 
 
 
172 aa  123  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  31.56 
 
 
388 aa  123  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.94 
 
 
176 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.27 
 
 
173 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  31.28 
 
 
388 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  28.87 
 
 
386 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  34.12 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  28.49 
 
 
415 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  30.68 
 
 
394 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  29.59 
 
 
401 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  30.79 
 
 
401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  30.24 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  30 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  30.25 
 
 
383 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  31.5 
 
 
386 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  28.69 
 
 
397 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  26.97 
 
 
394 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  30.92 
 
 
388 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  29.01 
 
 
395 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  26.97 
 
 
394 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  31.1 
 
 
400 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  28.25 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  26.47 
 
 
342 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  26.52 
 
 
386 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  22.15 
 
 
386 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 
188 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  30.16 
 
 
199 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  20.86 
 
 
380 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  24.09 
 
 
337 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  24.09 
 
 
337 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  35.04 
 
 
119 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.76 
 
 
166 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2781  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.14 
 
 
176 aa  63.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  23.62 
 
 
358 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  23.62 
 
 
279 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  23.23 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.94 
 
 
190 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.74 
 
 
204 aa  57  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675157  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 
334 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3057  glyoxalase family protein  25.79 
 
 
171 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2737  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.72 
 
 
163 aa  53.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0870171  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.81 
 
 
326 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2939  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.57 
 
 
190 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054707  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  29.31 
 
 
161 aa  50.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 
175 aa  48.9  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.45 
 
 
165 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  24.74 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.15 
 
 
347 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.15 
 
 
347 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>