51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3667 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  100 
 
 		 343 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  53.43 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  53.27 
 
 		 377 aa  355  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  39.17 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  39.41 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  39.6 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  35.55 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  37.86 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  34.58 
 
 		 421 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  34.23 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  35.15 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  33.63 
 
 		 394 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  35.98 
 
 		 401 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  36.59 
 
 		 401 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  32.47 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  33.72 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  34.2 
 
 		 395 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  31.63 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  30.38 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  32.34 
 
 		 402 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  28.86 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  31.02 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  31.63 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  31.09 
 
 		 386 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  30.95 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  30.96 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  29.65 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  28.92 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  32.62 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 		 545 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  26.77 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  26.99 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  27.06 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  28.49 
 
 		 383 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  28.05 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  28.05 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  28.57 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  30.77 
 
 		 343 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  28.01 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  29.6 
 
 		 400 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  29.17 
 
 		 394 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  25.62 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  28.87 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  25.49 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  22.57 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  22.57 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  24.22 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.61 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3962  hypothetical protein  32.58 
 
 		 274 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0275493  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1452  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.97 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>