52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1432 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  100 
 
 
377 aa  778    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  53.27 
 
 
343 aa  355  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  49.26 
 
 
362 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  37.13 
 
 
390 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  37.63 
 
 
389 aa  249  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  36.9 
 
 
383 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  36.46 
 
 
415 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  37.07 
 
 
394 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  37.5 
 
 
376 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  37.54 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  36.23 
 
 
394 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  36.62 
 
 
421 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  36.16 
 
 
396 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  34.91 
 
 
402 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  35.08 
 
 
401 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  35.69 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  33.44 
 
 
397 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  33.33 
 
 
395 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  32.83 
 
 
379 aa  176  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  35.45 
 
 
409 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  32.64 
 
 
365 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  33.94 
 
 
366 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  29.92 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  33.11 
 
 
343 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  32.34 
 
 
383 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  34.29 
 
 
388 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  29.52 
 
 
386 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  33.62 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  28.7 
 
 
358 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  32.94 
 
 
388 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  32.27 
 
 
386 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  29.63 
 
 
352 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.04 
 
 
545 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  25.96 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  27.49 
 
 
380 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  28.57 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  24.4 
 
 
386 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  25.99 
 
 
337 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  25.99 
 
 
337 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  26.35 
 
 
383 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  24.36 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  27.33 
 
 
394 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  27.33 
 
 
394 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  25.46 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  24.54 
 
 
279 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  25.15 
 
 
358 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  27.39 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  31 
 
 
119 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  24.36 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  32.32 
 
 
353 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  23.2 
 
 
286 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  32.32 
 
 
353 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>