51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0624 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  100 
 
 
388 aa  771    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  97.68 
 
 
388 aa  723    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  86.08 
 
 
388 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  62.34 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  40.46 
 
 
394 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  39.18 
 
 
415 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  40.85 
 
 
394 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  41.55 
 
 
383 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  42.18 
 
 
379 aa  252  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  39.28 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  42.57 
 
 
409 aa  229  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  36.14 
 
 
390 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  31.83 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  34.63 
 
 
362 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  37.68 
 
 
383 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  33.07 
 
 
401 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  32.63 
 
 
377 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  32.65 
 
 
421 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  35.42 
 
 
376 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  31.96 
 
 
389 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  34.93 
 
 
401 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  32.02 
 
 
358 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  32.45 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  32.12 
 
 
403 aa  153  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  34.52 
 
 
365 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  33.82 
 
 
396 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  34.17 
 
 
366 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  31.08 
 
 
397 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  31.73 
 
 
352 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  32.85 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  34.47 
 
 
400 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  30.28 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  30.03 
 
 
337 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  30.28 
 
 
394 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  30.03 
 
 
337 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  28.98 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  30.26 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  34.78 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  28.23 
 
 
386 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  32.16 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  32.53 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.7 
 
 
545 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  27.01 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  29.67 
 
 
386 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  27.48 
 
 
358 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  26.91 
 
 
358 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  27.72 
 
 
279 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  35.63 
 
 
119 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.95 
 
 
312 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  38.71 
 
 
102 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.76 
 
 
354 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>