51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4434 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  739    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  72.13 
 
 
365 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  47.76 
 
 
358 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  44.28 
 
 
352 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  44.98 
 
 
374 aa  269  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  39.19 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  36.28 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  35.91 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  32.08 
 
 
377 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.54 
 
 
545 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  29.65 
 
 
343 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  34.69 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  33.82 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  34.86 
 
 
376 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  34.6 
 
 
401 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  32.55 
 
 
394 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  29.16 
 
 
362 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  36.33 
 
 
421 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  34.37 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  32.29 
 
 
394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  33.99 
 
 
383 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  30.17 
 
 
390 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  35.91 
 
 
388 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  35.01 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  32.67 
 
 
397 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  34.44 
 
 
388 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  31.64 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  31.92 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  33.73 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  33.65 
 
 
409 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  32.4 
 
 
379 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  28.93 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  52.29 
 
 
119 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  29.55 
 
 
386 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  29 
 
 
343 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  29.39 
 
 
383 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  59.74 
 
 
102 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  27.65 
 
 
394 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  27.23 
 
 
394 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  25.3 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  25.3 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  27.36 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  26.26 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  28.95 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  23.84 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  23.03 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  26.28 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  25.76 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  27.69 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  25 
 
 
288 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  25 
 
 
288 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>