49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4323 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  100 
 
 
352 aa  717    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  49.41 
 
 
358 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  44.28 
 
 
366 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  42.73 
 
 
365 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  48.49 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  34.24 
 
 
377 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  32.63 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  32.51 
 
 
390 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  26.77 
 
 
343 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  29.63 
 
 
377 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  31.07 
 
 
402 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  31.31 
 
 
421 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  31.36 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  31.91 
 
 
376 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  31.92 
 
 
383 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.21 
 
 
545 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  31.73 
 
 
388 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  30.68 
 
 
394 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  31.44 
 
 
388 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  29.75 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  31.44 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  31.42 
 
 
394 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  32.46 
 
 
401 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  30.12 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  32.07 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  29.39 
 
 
389 aa  126  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  39.34 
 
 
395 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  30 
 
 
403 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  29.79 
 
 
386 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  28.9 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  25.61 
 
 
362 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  28.31 
 
 
409 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  28.99 
 
 
379 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  28.44 
 
 
337 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  28.44 
 
 
337 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  27.63 
 
 
342 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  47.66 
 
 
119 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  25.16 
 
 
386 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  28.66 
 
 
386 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  27.73 
 
 
380 aa  92.8  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  28.03 
 
 
343 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  28.66 
 
 
383 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  54.93 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  21.08 
 
 
394 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  20.48 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  25.66 
 
 
400 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  18.84 
 
 
358 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  20.92 
 
 
358 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  20.92 
 
 
279 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>