38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1997 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  243  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  52.29 
 
 
366 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  48.15 
 
 
365 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  47.66 
 
 
352 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  46.23 
 
 
374 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  38.32 
 
 
358 aa  77.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  48.81 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.04 
 
 
545 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  34.58 
 
 
343 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  31.78 
 
 
377 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  35.63 
 
 
388 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  35.63 
 
 
388 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  35.11 
 
 
386 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  32.32 
 
 
362 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  34.48 
 
 
388 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  28.57 
 
 
343 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  28.7 
 
 
415 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  36.17 
 
 
402 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  30.91 
 
 
386 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  31 
 
 
377 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  30.61 
 
 
396 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  31.68 
 
 
337 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  31.68 
 
 
337 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  26.74 
 
 
383 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  27.06 
 
 
394 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  27.06 
 
 
394 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  29.17 
 
 
403 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  37.5 
 
 
421 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  25.47 
 
 
394 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  27.36 
 
 
383 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  28.12 
 
 
379 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  28.71 
 
 
389 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  24.53 
 
 
394 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  30.11 
 
 
380 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  31.58 
 
 
383 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  30.26 
 
 
386 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  25.86 
 
 
342 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>