52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1771 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  753    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  47.77 
 
 		 409 aa  299  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  43.21 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  41.47 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  34.45 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  34.52 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  34.87 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  35 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  38.24 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  37.68 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  36.62 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  36.41 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  32.1 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  27.02 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  31.41 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  26.35 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  29.53 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  25.49 
 
 		 343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.97 
 
 		 545 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  31.91 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  32.29 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  31.99 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  30 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  30.32 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  32.34 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  32.44 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  28.41 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  31.63 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  29.2 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  29.39 
 
 		 366 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  30.5 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  33.14 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  30.21 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  26.21 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  26.02 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  28.66 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  25.73 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  27.09 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  27.09 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  25.57 
 
 		 394 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  25.58 
 
 		 380 aa  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  28.2 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  29.59 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  26.79 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  24.64 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  24.48 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  24.48 
 
 		 279 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3590  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.21 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  39.13 
 
 		 102 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  24.91 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  24.3 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.4 
 
 		 309 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>