47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1409 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  96.04 
 
 
358 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  96.04 
 
 
358 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  41.43 
 
 
394 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  41.07 
 
 
394 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  31.01 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  28.26 
 
 
415 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  28.89 
 
 
394 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  27.78 
 
 
394 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  31.41 
 
 
409 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  30.18 
 
 
343 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  26.81 
 
 
380 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  28.25 
 
 
379 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  27.37 
 
 
383 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  26.84 
 
 
337 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  26.84 
 
 
337 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  28.68 
 
 
342 aa  99  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  26.38 
 
 
403 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  26.38 
 
 
396 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  28.84 
 
 
388 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  27.21 
 
 
386 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  28.77 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  25.78 
 
 
421 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  24.54 
 
 
377 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  25.56 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  27.73 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  24.91 
 
 
390 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  27.72 
 
 
388 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  24.91 
 
 
389 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  28.57 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  24.22 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  27.99 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  25.18 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  25.84 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  28.96 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  24.45 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  25.27 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  24.48 
 
 
383 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  24.34 
 
 
383 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  24.26 
 
 
386 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  27.69 
 
 
366 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  22.83 
 
 
397 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.62 
 
 
545 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  22.75 
 
 
402 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  23.39 
 
 
374 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  22.69 
 
 
358 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  20.92 
 
 
352 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>