47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3279 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  81.47 
 
 		 401 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  90.95 
 
 		 395 aa  722    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  793    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  80.46 
 
 		 401 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  57.87 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  57.66 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  41.51 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  40.33 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  40.74 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  38.33 
 
 		 415 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  37.27 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  36.55 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  38.32 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  38.32 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  33.72 
 
 		 343 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  34.52 
 
 		 362 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  34.14 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  33.44 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  32.03 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  31.41 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  32.67 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  31.87 
 
 		 388 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  32.68 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  33.9 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  31.32 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  31.01 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  32.4 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  31.83 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  31.97 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  32.07 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  27.87 
 
 		 386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  27.68 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  27.68 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  27.82 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  31.32 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  27.68 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  27.64 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 		 545 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  27.11 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  32.44 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  29.31 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  27.99 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  28.14 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  27.22 
 
 		 343 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  22.65 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  21.72 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  23.97 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>