50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2718 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  88.32 
 
 		 394 aa  713    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  794    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  70.44 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  69.6 
 
 		 383 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  41.9 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  42.03 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  43.27 
 
 		 409 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  41.27 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  38.98 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  42.46 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  38.14 
 
 		 386 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  36.78 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  37.07 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  37.88 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  39.48 
 
 		 376 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  34.23 
 
 		 343 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  36.29 
 
 		 362 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  36.6 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  37.99 
 
 		 401 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  36.78 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  36.14 
 
 		 403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  34.85 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  36.46 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  34.27 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  35.84 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  35 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  32.4 
 
 		 377 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  33.24 
 
 		 366 aa  156  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  33.24 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  29.1 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  30.15 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  30.15 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  31.45 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  27.42 
 
 		 386 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  30.52 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  31.42 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  28.61 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  29.14 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  28.61 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  29.35 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.68 
 
 		 545 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  31.46 
 
 		 343 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  27.3 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  33.7 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  28.78 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  25.61 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  27.78 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  25.47 
 
 		 119 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.9 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.88 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>