48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3083 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  87.84 
 
 
403 aa  736    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  100 
 
 
396 aa  821    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  44.51 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  39.45 
 
 
389 aa  229  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  42.77 
 
 
376 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  37.86 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  40.49 
 
 
421 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  37.88 
 
 
394 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  40.3 
 
 
401 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  38.34 
 
 
415 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  40 
 
 
383 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  36.65 
 
 
394 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  37.5 
 
 
362 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  36.16 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  38.48 
 
 
401 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  38.79 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  38.44 
 
 
397 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  34.6 
 
 
402 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  35.76 
 
 
386 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  31.31 
 
 
358 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  32.29 
 
 
374 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  35.69 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  34.11 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  33.82 
 
 
388 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  28.65 
 
 
386 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
545 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  32.46 
 
 
366 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  31.14 
 
 
365 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  31.58 
 
 
380 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  29.41 
 
 
377 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  31.23 
 
 
394 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  31.23 
 
 
394 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  31.83 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  28.9 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  30.59 
 
 
379 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  32.01 
 
 
409 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  27.98 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  31.41 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  28.81 
 
 
342 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  30.94 
 
 
400 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  29 
 
 
337 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  29 
 
 
337 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  25.23 
 
 
358 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  27.54 
 
 
358 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  26.38 
 
 
279 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  29.2 
 
 
383 aa  96.7  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  29.08 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  30.61 
 
 
119 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>