49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1035 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  73.93 
 
 		 366 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  46.9 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  40.9 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  43.37 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  38.32 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  34.91 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  30.12 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.67 
 
 		 545 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  31.61 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  29.28 
 
 		 362 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  31.87 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  30.6 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  34.35 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  34.35 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  33.06 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  35.62 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  30.91 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  30.79 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  35.42 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  33.04 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  30.45 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  32.63 
 
 		 401 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  34.76 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  34.72 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  31.48 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  29.82 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  32.98 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  32.05 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  30.59 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  31.45 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  48.15 
 
 		 119 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  27.68 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  24.77 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  24.77 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  59.72 
 
 		 102 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  27.56 
 
 		 380 aa  92.8  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  27.39 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  25.28 
 
 		 342 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  27.13 
 
 		 394 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  26.42 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  28.26 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  25.82 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  23.97 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  27.36 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  27.88 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  26.99 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  28.96 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>