50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4095 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  793    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  46.43 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  39.41 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  37.63 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  40.21 
 
 		 401 aa  245  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  44.2 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  40 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  40.33 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  40 
 
 		 401 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  40.61 
 
 		 395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  38.17 
 
 		 421 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  39.45 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  37.01 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  36.42 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  37.39 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  34.99 
 
 		 415 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  34.27 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  33.52 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  34.39 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  34.1 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  33.62 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  31.88 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  33.61 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  34.76 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  33.06 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  29.63 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  31.25 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  29.38 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  29.63 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  31.48 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  30.86 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.38 
 
 		 545 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  30.48 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  30.48 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  31.06 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  28.36 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  30.18 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  29.54 
 
 		 394 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  29.02 
 
 		 394 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  28.27 
 
 		 386 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  32.19 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  29.39 
 
 		 352 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  29.07 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  29.63 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  25.5 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  25.21 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  24.91 
 
 		 279 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.34 
 
 		 279 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  28.71 
 
 		 119 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.99 
 
 		 1364 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>