51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2714 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  769    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  69.32 
 
 
394 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  68.09 
 
 
415 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  69.6 
 
 
394 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  41.71 
 
 
388 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  41.71 
 
 
388 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  42.44 
 
 
409 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  38.25 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  38.03 
 
 
379 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  40.22 
 
 
362 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  40.77 
 
 
388 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  39.77 
 
 
390 aa  237  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  42.35 
 
 
386 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  42.24 
 
 
401 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  39.41 
 
 
401 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  41.06 
 
 
395 aa  229  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  36.9 
 
 
377 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  42.18 
 
 
376 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  39.89 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  35.55 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  39.66 
 
 
421 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  40 
 
 
396 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  36.27 
 
 
389 aa  206  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  39.53 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  36.78 
 
 
402 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  34.87 
 
 
383 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  32.8 
 
 
377 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  33.99 
 
 
366 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  34.22 
 
 
365 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  30.47 
 
 
342 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  29.73 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  29.73 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  31.56 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  32.49 
 
 
352 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  29.97 
 
 
374 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  31.61 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  30.83 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  30.13 
 
 
394 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  31.87 
 
 
383 aa  126  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  33.43 
 
 
400 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  29.6 
 
 
394 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  30.03 
 
 
380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  31.8 
 
 
343 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  27.25 
 
 
358 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  27.25 
 
 
358 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  27.37 
 
 
279 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.63 
 
 
304 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.48 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  27.36 
 
 
119 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  30 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>