48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0198 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  820    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  37.37 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  39.76 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  36.23 
 
 		 389 aa  209  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  35.44 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  37.54 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  33.78 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  33.24 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  36.42 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  34.76 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  36.78 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  34.06 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  32.34 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  33.07 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  35.63 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  34.14 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  36.03 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  33.07 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  35.84 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  31.75 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 		 545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  32.84 
 
 		 358 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  34.31 
 
 		 383 aa  170  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  34.3 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  34.62 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  30.46 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  32.6 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  32.75 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  33.52 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  35.92 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  33.82 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  31.93 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  30.66 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  29.62 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  28.57 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  29.39 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  29.39 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  23.08 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  26.42 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  30.21 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  28.77 
 
 		 394 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  28.22 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  24.8 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  24.5 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  23.99 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  25.54 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  22.75 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  36.17 
 
 		 119 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>