51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0613 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  97.68 
 
 		 388 aa  723    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  769    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  86.34 
 
 		 388 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  62.34 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  40.71 
 
 		 394 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  39.18 
 
 		 415 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  40.85 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  43.3 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  42.33 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  39.79 
 
 		 386 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  42.86 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  36.14 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  32.43 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  35.82 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  38.24 
 
 		 383 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  33.16 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  32.47 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  35.42 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  33.69 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  36.01 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  35.52 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  32.9 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  32.98 
 
 		 395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  32.02 
 
 		 358 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  34.52 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  34.72 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  31.62 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  34.11 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  31.44 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  33.24 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  34.72 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  29.87 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  31.14 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  31.14 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  35.71 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  31.27 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  30 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  30 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  28.15 
 
 		 386 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  33.43 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  32.75 
 
 		 374 aa  116  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  28.5 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  26.89 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.7 
 
 		 545 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  28.05 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  27.48 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  28.84 
 
 		 279 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  35.63 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.93 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  38.71 
 
 		 102 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.1 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>